第二届， 2000年10月12日-17日 ，主题（亮点）： 扩大规模，积极探索  ， 出席的中央领导：中共中央政治局委员、 国务院副总理吴邦国。

　　第二届高交会于2000年10月11日－17日在扩建后的高交会展览中心举行。时任国务院副总理吴邦国出席了开幕式并致词。第二届高交会的内容由高新技术成果展示与交易、高新技术专业产品展、高新技术论坛三大部分构成。专业产品展新增了“生物技术专业产品展”和“新材料专业产品展”两个专业展。

　　第三届， 2001年10月12日-17日， 主题（亮点）：组织实力更强，专业主题更突出  ，出席的中央领导：中共中央政治局候补委员、国务委员吴仪 。

　　2001年10月12日至17日，第三届高交会在高交会展览中心和深圳市市民中心举行。时任国务委员吴仪出席了开幕式并致词。第三届高交会的内容由高新技术成果交易、高新技术专业产品展示与交易、高新技术论坛三大部分构成。

　　第四届， 2002年10月12日-17日 ， 主题（亮点）：国际证券交易机构首次大规模在中国聚会，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、广东省委书记李长春 ，全国人大常委会副委员长周光召。

　　2002年10月12日至17日，第四届高交会在高交会展览中心和深圳市市民中心举行。时任全国人大常委会副委员长周光召出席了开幕式并致词。第四届高交会依然由高新技术成果交易、高新技术专业产品展示与交易、高新技术论坛三大部分内容构成。 

　　第五届， 2003年10月12日-17日 ， 主题（亮点）：着力营造更加安全舒适的展会环境，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、国务院副总理吴仪 。

　　2003年10月12日至17日，第五届高交会在高交会展览中心举行。时任国务院副总理吴仪出席了开幕式并致词。第五届高交会主要内容包括“高新技术成果交易”、“高新技术专业产品展”、“中国高新技术论坛”、“super-SUPE系列活动”及“不落幕的交易会”五大部份。

　　第六届， 2004年10月12日-17日， 主题（亮点）：“国际化”程度越来越高，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、国务院副总理吴仪 。

　　第七届， 2005年10月12日-17日 ，  主题（亮点）： 自主创新，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、国务院副总理曾培炎 。

　　第七届届高交会是一次盛况空前、国际化和自主创新色彩浓厚的高科技盛会。来自世界各地的104个代表团、3464家参展商和1896家投资商参加了展示、交易和洽谈。国外23个国家和国际组织、中国内地所有的36个省、自治区、直辖市、计划单列市和26所高校以及港澳台地区组团参展参会，国内外65家知名跨国公司参加了展示与交易，专业展海外展区面积所占比例达38%。

　　第八届， 2006年10月12日-17日，   主题： 自主创新 循环经济 知识产权保护，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、国务院副总理吴仪 。

　　第八届高交会是“十一五”规划和全国科技大会做出自主创新战略部署和十六届六中会会做出构建社会主义和谐社会重要决定后首度举办的高交会。从新形势下的国家发展战略出发，第八届高交会紧扣科技和经济发展热点，突出“自主创新、循环经济、知识产权保护”三大主题，着力强化四大功能。

　　第九届， 2007年10月12日-17日 ，  主题： 推进开放创新 保护知识产权 创建和谐社会，  出席的中央领导：全国人大常委会副委员长蒋正华 。

　　第九届高交会在建设创新型国家的战略指引下，着力突出“推进开放创新”、“保护知识产权”、“创建和谐社会”三大主题，呈现出浓厚的“开放、创新、和谐”特色。国防科工委自上届高交会加入高交会主办单位行列后，首次组团参展；推出了中美“1+3”系列活动。

　　第十届， 2008年10月12日-17日，   主题： 科技改善民生 创新改变世界，  出席的中央领导：全国人大常委会副委员长桑国卫 。

　　第十一届， 2009年11月16日-21日 ， 主题： 创新·创业·发展，  出席的中央领导：全国人大常委会副委员长周铁农 。

　　第十二届， 2010年11月16日-21日，  主题： 科技引领转型 创新驱动发展，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、 国务院副总理回良玉 。

　　第十三届， 2011年11月16日-21日，  主题： 促进国际创新合作 加快发展方式转变，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、广东省委书记汪洋 。

　　第十四届， 2012年11月16日-21日，   主题： 推进科技创新 提升发展质量，  出席的中央领导：全国人大常委会副委员长路甬祥 。

　　第十四届高交会是一届贯彻落实党的十八精神，突出创新驱动发展战略的盛会。第十四届高交会以“推进科技创新，提升发展质量”为主题，通过一系列的展览、论坛和活动，突出展示我国以创新驱动发展，取得了令人瞩目的丰硕成果。

　　第十五届 ，2013年11月16日-21日，   主题： 坚持创新驱动发展 提高经济增长质量，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、国务院副总理汪洋 。

　　第十六届 ，2014年11月16日-21日，    主题： 坚持创新驱动 加快绿色发展，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、国务院副总理刘延东 。

　　第十六届高交会总展览面积达11.5万平方米，共有包括37个外国团组在内的3016家展商参展，带来的高新技术项目与产品数达3593项，涵盖了节能环保、新一代信息技术、生物、高端装备制造、新能源、新材料、新能源汽车和现代农业等领域。来自83个国家和地区、123个代表团在内的54.6万人次参会。

　　第十七届 ，2015年11月16日-21日，    主题： 创新创业 跨界融合，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、广东省委书记胡春华 。

　　第十八届 ，2016年11月16日-21日，    主题： 创新驱动 质量引领，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、广东省委书记胡春华 。

　　第十九届 ，2017年11月16日-21日，    主题： 聚焦创新驱动 提升供给质量，  出席的中央领导：中共中央政治局委员、广东省委书记李希 。